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Microscopía de superresolución 3D combinando el algoritmo SUPPOSe con fluorescencia por reflexión total interna.

Autor

Charrut, Matías Ezequiel

Título

Microscopía de superresolución 3D combinando el algoritmo SUPPOSe con fluorescencia por reflexión total interna.

Colaborador

Toscani, Micaela

Martínez, Oscar Eduardo

Descripción

Grado obtenido: Ingeniero/a Electrónico de la Universidad de Buenos Aires

Disciplina: Ingeniería Electrónica

Fil: Charrut, Matías Ezequiel. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ingeniería.

Editor

Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ingeniería

Fecha

2023-05-18

Extensión

101 p.

Resumen

En este trabajo se desarrolló un sistema de microscopía que permite adquirir imágenes en tres dimensiones excitando la muestra mediante la técnica de fluorescencia por reflexión total interna o TIRF para luego ser procesadas utilizando el algoritmo SUPPOSe 3D. Este método de deconvolución con superresolución permite reconstruir la estructura verdadera presente en una imagen incorporando la información a priori que propone la aproximación SUPPOSe, la cual consiste en aproximar la estructura real en la muestra como una superposición de fuentes puntuales de igual intensidad, llamadas fuentes virtuales. Esto permite simplificar el problema de deconvolución y lo convierte en un problema de minimización sin restricciones, que debe resolverse encontrando las posiciones de las fuentes virtuales. Estas posiciones pueden tomar valores en todo el dominio y se encuentran minimizando una función objetivo a través de un algoritmo genético. A lo largo de esta tesis se puso a prueba el método SUPPOSe para imágenes en tres dimensiones tanto generadas sintéticamente como adquiridas de manera experimental con el sistema implementado. Utilizando muestras con estructuras conocidas se validaron los resultados obtenidos y evaluando el rendimiento del algoritmo en función de las características de las imágenes procesadas.